آنهاحواشى بر كتب حكميه ملاصدرا و ميرداماد است، آثار مستقل وى عبارتند از: 1 . حجة الاسلام ملقب به برهان الملّة در ردّ بخش سوم كتاب «ميزان الحق» 2 . تفسير سوره توحيد به نام السراج المنير 3 . الرقيمة النورية في قاعدة بسيط الحقيقة 4 . شرح حديث زينب عطاره 5 . شرح حديث نورانيت 6 . شرح حديث «هل رأيت رجلاً...» 7 . رساله امامت 8 . رساله در حقيقت قرآن 9 . اجوبه مسايل گوناگون حكمى پاره اى از حواشى كتب حكمى وى عبارتند از: 1 . حواشى «نبراس الضياء» ميرداماد 2 . حواشى «تقويم الايمان» ميرداماد 3 . حواشى «جذوات» ميرداماد 4 . حواشى «اسفار» ملاصدرا 5 . حواشى «اسرار الايات» ملاصدرا 6 . حواشى «تفسير قرآن» ملاصدرا 7 . حواشى رساله «قضاء و قدر» ملاصدرا؛ و... پاره اى از حواشى وى بر كتب علوم نقلى عبارتند از: 1 . حاشيه «تفسير صافى» فيض كاشانى 2 . حاشيه «لهوف» سيد بن طاووس و...