محل قبر نظرات مختلف دارند. آنچه مشهور است عبارت است از:

1- در خانه خود آن بزرگوار؛ كه فعلًا قسمتى از آن داخل مسجد و قسمتى هم در شمال قبر پيغمبر، جزء حجره طاهره است. علامه مجلسى، شيخ صدوق و شيخ طوسى اين قول را صحيح دانسته و از حضرت رضا (ع) در «تهذيب و من لايحضره الفقيه» روايت شده كه آن بى‌بى دو عالم در بيت خود مدفون است و چون مسجد وسعت يافت، قبر آن حضرت در مسجد واقع شد.

2- در قبرستان بقيع نزديك به قبور ائمه؛ قائلين به اين قول زياد هستند، اگر چه شيخ صدوق اين قول را بعيد دانسته است.

3- در روضه مباركه بين قبر و منبر پيغمبر؛ فرموده‌اند كه شايد كلام رسول خدا (ص) كه فرمود: بين قبرى و منبرى روضه من رياض‌الجنه،[1] ناظر به همين باشد. محدث قمى مى‌فرمايد: زيارت كن آن حضرت را در نزد روضه مطهره. سپس مى‌گويد: در موضع قبر آن مظلومه اختلاف است؛ طايفه‌اى گفته‌اند كه مدفون است در روضه و بعضى گفته‌اند در خانه خودش است و فرقه سوم گفته‌اند در بقيع مدفون است و آنچه بيشتر اصحاب ما بر آن مى‌باشند آن است كه زيارت قبر آن مظلومه در روضه مباركه بايد باشد.

به هر حال كسى كه مى‌خواهد فاطمه (س) را زيارت كند اين سه موضع افضل است. پس از زيارت، دو ركعت نماز بخواند كه افضل، نماز خود آن حضرت است كه جبرئيل به ايشان تعليم فرمود و آن چنين است كه بعد از حمد، در ركعت اول صد مرتبه سوره‌قدر و در ركعت دوم صد مرتبه سوره‌توحيد است.

[1] - معانى‌الاخبار، ج 1، ص 267.