فمن تلامذته البارزين:

السيد محمد بن علي الموسوي العاملي المتوفى سنة (1009هـ) مؤلف (مدارك الأحكام في شرح شرائع الإسلام) وغيره من الكتب النافعة.

الشيخ حسن بن زين الدين العاملي ابن الشهيد الثاني المتوفى سنة (1011هـ) مؤلف (معالم الدين) و (منتقى الجمان في الأحاديث الصحاح والحسان).

ويعد بعض آخر من تلامذة مدرسته ومنهجه ولم يتتلمذوا عليه مباشرة، مثل المولى محمد باقر بن محمد مؤمن السبزواري المتوفى سنة (1090هـ) مؤلف كتاب (كفاية الأحكام) و (ذخيرة المعاد). ومثله الملا محسن الفيض الكاشاني المتوفى (1091هـ) مؤلف كتاب الوافي ومفاتيح الشرائع، فإنه وإن كان اتجاهه العام محسوبا على الأخباريين إلا أنه كان يبدي الاعجاب بطريقة المحقق الأردبيلي ويتفق معه ومع تلامذته في اختياراتهم كما أشار إلى ذلك بعض المؤلفين [1].

[1] المدرسي، السيد حسين: مقدمه‌اى بر فقه شيعه (فارسي) 57.