في هذه المرحلة تحسست الحوزات العلمية و خصوصا حوزة النجف الأشرف ما تعانيه مناهج التدريس و الكتب المعتمدة في شتى العلوم الإسلامية من تخلف و تعقيد و تكاثرت الانتقادات الموجهة إلى مناهج التدريس سواء في ذلك ما يتعلق بالعلوم العربية أو المنطق أو الفلسفة أو علم الأصول، و طرحت أفكار نقدية تتناول الشكل و المضمون حيث أنه لوحظ أن الكتب المتداولة تتضمن أبحاثا لا حاجة إليها و لا مبرر لصرف العمر في درسها، أو لا حاجة إلى أن تكون في شكلها التي دونت فيه موضوعا للدراسة، حيث أنها تتعرض لأبحاث جانبية و استطرادية تستهلك وقتا طويلا من الطالب و ليست ضرورية لنموه العلمي، أو من حيث الشكل الذي يتناول صيغة العبارة أو يتناول تبويب الأبحاث العلمية.

و كثر هذا النقد على الصيغة التي يدرّس بها علم الأصول في الحوزات، في الكتب السائدة و المتداولة التي ذكرناها، و كان، أن نشأت قضية تحديث مناهج دراسة و كتب الدراسة و توجهت الأنظار لوضع كتب بديلة تحل محل الكتب السائدة و تأخذ بالاعتبار الانتقادات التي أشرنا إليها في المضمون و الشكل.

و قد ترافقت هذه النظرة مع نظرة أخرى تتناول تحديث الدراسة و أسلوب الدراسة و إدخال التنظيم الدراسي المتّبع في الجامعات الحديثة إلى الدراسة الدينية في النجف الأشرف. و جعل الدراسة في نطاق كليات تكون لها مناهج مبرمجة و موزعة على سنوات محددة و تكون لها امتحانات.

و قد تجسدت هاتان النظرتان في النجف الأشرف في عملية رائدة قام ثلّة من علماء النجف كان في مقدمتهم آية اللّه المجتهد المجدد الشيخ محمد رضا المظفر (رضوان اللّه عليه) الذي عمل على تأسيس (جمعية منتدى النشر) لتكون الإطار التنظيمي و المؤسسي للتعبير عن فكرة التحديث في الدراسات الدينية مضمونا و منهجا و كتبا دراسية.

لقد حوربت الفكرة و واجهت معارضة شديدة من بعض أوساط الحوزة العلمية، و قابلها بعض آخر بحذر و تحفظ، و تحمس لها بعض قليل.

و لكن الجمعية بقيادة الشيخ المظفر لم تتراجع عن مشروعها الكبير