١ ـ النسخة المودعة في مكتبة كلية الإلهيات ـ جامعة طهران ، رقمها (٢٩٤٨) ، كتبها محمد بن الحسن بن الحاج حافظ الأميري في ١٤ محرم الحرام ١١١٤ ه‌ وتبدأ من أواخر سورة يونس إلى آخر التفسير ، الموجود لدينا منها يبدأ من أواخر سورة الاسراء إلى آخر الكتاب. ورمزنا لها بالحرف «ج».

٢ ـ النسخة المودعة في المكتبة الرضوية (آستانه قدس رضوي) ـ مشهد المقدسة ، رقمها (١٤٣٤٤) كتبها السيد عبدالله في سنة ١٢٦٢ ه‌ ، تبدأ من أوائل المقدمة حيث سقط بعض أوراقها وتنتهي بآخر سورة الكهف ، وهذه النسخة تطابق النسخة التالية (نسخة مكتبة سبهسالار) من حيث الكاتب والبداية والسقط والتصحيف والبياض وغيرها ، وكأن النسخة التالية منقولة عن هذه النسخة ، قابلنا منها المقدار المفقود من أواخر سورة الكهف من النسخة التالية. ورمزنا لها بالحرف «ق».

٣ ـ النسخة المودعة في مكتبة سبهسالار ـ طهران ، رقمها (٢٠٥٧) ، كتبها السيد عبدالله في سنة ١٢٦٨ ه‌ ، تبدأ من أوائل المقدمة حيث سقط بعض أوراقها وتنتهي بالآية (١٨) من سورة الكهف ، وهذه النسخة تطابق النسخة السابقة (نسخة المكتبة الرضوية) من حيث الكاتب والبداية والسقط والتصحيف والبياض وغيرها ، وكأنها منقولة عنها ، قابلناها كلها ، وأكملنا الأوراق المفقودة من آخرها والتي تبدأ من الآية (١٨) من سورة الكهف إلى آخر السورة من النسخة السابقة. ورمزنا لها بالحرف «س».

٤ ـ النسخة المطبوعة على الحجر في إيران سنة ١٣٠٢ ه‌ ، تبدأ من أول سورة مريم إلى آخر الكتاب ، قوبلت بتمامها ، ورمزنا لها بالحرف «ي».

٥ ـ الطبعة الحروفية ذات الأجزاء الأربعة ، طبع مؤسسة إسماعيليان ـ قم المقدسة ، تبدأ من أول التفسير إلى آخره ، وقد قوبلت بها جميع النسخ والمصادر ورمزنا لها بالحرف «ط».