محدّث قمى در الفوائد الرضوية مى‌فرمايد:

عالم فاضل كامل جامع معقول و منقول. او و برادر بزرگترش آقا جمال در دامان علم متولّد و در سايه كمال رشد يافتند و نزد پدر خود آقا حسين ودائى خود محقّق سبزوارى تلمذ كردند و بلغا ما بلغا ....

علامه طهرانى در أعلام الشيعة مى‌گويد:

عالمى فاضل، متكلّمى شاعر، و صاحب تأليفاتى است. وى يكى از چند نفرى است كه حكم شاه سلطان حسين درباره نهى از منكرات را امضا نمود. يكى از شاگردان او گويد كه در مجلس درس او دويست تا سيصد نفر حاضر مى‌شدند.

حزين لاهيجى در سفرنامه و ملحقات آن مى‌نويسد:

فاضل عالى شأن آقا رضى الدين محمّد و خلف علامه نحرير آقا حسين خوانسارى از اذكياى علما بود. طبعى به غايت دقيق و فكرتى عالى داشت، در خدمت او بسيارى از فضلاء مستفيد شدند.

مدرّس تبريزى در ريحانة الأدب مى‌فرمايد:

رضى الدين محمّد بن آقا حسين خوانسارى برادر كهتر آقا جمال خوانسارى كه پيش از او در جوانى وفات يافته و هر دو برادر مسمّى به محمّد بوده‌اند.

تأليفات و آثار

1. حاشيه شرح لمعه.

2. حاشيه [شرح‌] حكمت العين.

3. حاشيه بر حاشيه خفرى بر الهيات شرح تجريد قوشجى.

4. ترجمه نهج الحق علّامه حلّى قدس سره.

5. شرح دروس شهيد اوّل. چون شرح دروس پدرش ناقص مانده بود مى‌خواست آن را تكميل كند و موفّق شد كه كتاب صوم و اعتكاف را بنويسد كه اين كتاب ضميمه شرح دروس پدرش چاپ شده است.

6. مائده سماويه.