بر محاكم انقلاب است كه برطبق فرمان الهى با آنان رفتار نمايندو بى‌كم و كاست حكم قرآن كريم را اجرا نمايند و به خواست خداوند فتنه را بخوابانند و از تجاوز افراد خوددارى نمايند. [1]

اين‌جانب از دادگاه‌هاى انقلاب مى‌خواهم كه با مراعات جانب عدل اسلامى با قاطعيت انقلابى با اين مفسدان و تباه‌كنندگان حرث و نسل رفتار و احكام قرآن مجيد را در بارۀ آنان اجرا نمايند و به ياوه‌گويى همان كسانى كه به حدود اسلامى پايبند نيستند، گوش فرا ندهند كه اجراى حدود و قصاص و تعزير اسلامى، بيمه‌كنندۀ حيات و نظام كشور است و سستى و سهل‌انگارى در اين امر، ترحم به پلنگ تيزدندان است. [2]

امام همچنين-با توجه به حساسيت مناطق جنگى به‌ويژه استان خوزستان كه عوامل دشمن در آن‌جا بيش‌تر از مناطق ديگر به جاسوسى و شرارت مشغول بودند-براى مهار فعاليت ستون پنجم، طى اقدامى قاطع سير مراحل تشكيل پرونده و محاكمه در دادگاه و تصويب احكام صادره به وسيلۀ شوراى عالى قوۀ قضائيه را كوتاه، و اختيارات قضايى را به هيأتى واگذار نمود:

بايد با افراد شرور و شيوخ فاسد و ضدانقلابى كه اكثراً با عراق و با ضدانقلاب خارج از كشور ارتباط داشته‌اند، برخورد شود، و از آن‌جا كه استان خوزستان درگير جنگ است و اين برخورد نمى‌تواند سير طبيعى و قانونى خود را بنمايد، بلكه بايد سريعاً اقدام گردد، به هيأتى مركب از آقايان استاندار و مدير كل اطلاعات و دادستان يا نمايندگانشان در آن استان متّفقاً اجازه داده مى‌شود تا به هر نحو صلاح مى‌دانند، با دشمنان برخورد نمايند. [3]