تشييع به حدى بود كه بسيارى از مردم امكان همراهى تابوت حامل پيكر معظم له را به دست نياوردند. به سبب ازدحام جمعيت تابوت حامل پيكر معظم له در نزديكى حرم مطهر از مسير پيش‌بينى شده تغيير جهت يافت و از طريق مدرسه دار الشفاء و فيضيه ساعت 35/ 12 وارد صحن حرم مطهر شد. و پس از طواف در اطراف ضريح مطهر براى اقامه نماز بر پيكر مطهر به صحن بزرگ انتقال يافت.

نماز بر پيكر مطهر توسط حضرت آيت اللّه العظمى صافى گلپايگانى اقامه شد. پس از اقامه نماز ميت بر پيكر مطهر معظم له بر روى دستان انبوه جمعيت عزادار براى تدفين در كنار مرقد استاد بزرگوارش حضرت آيت اللّه العظمى شيخ عبد الكريم حائرى قدس سرّه به داخل حرم مطهر انتقال يافت. لكن بر اثر ازدحام جمعيت در اطراف محل تدفين، خاكسپارى پيكر مطهر معظم له به تأخير افتاد. و سرانجام پيكر مرجع عاليقدر جهان تشيّع مقارن ساعت 15 روز شنبه- 26 جمادى الثانيه 1414- در ميان ناله‌هاى شديد مردم و فرياد «الوداع، الوداع» آنها در مسجد بالا سر حضرت معصومه عليهم السّلام كنار مرقد استاد گرانقدرش توسط آيت اللّه انصارى به خاك سپرده شد. و براى هميشه سيماى نورانيش از ديدگان محو گرديد. ولى انوار تابناك وجود مبارك و آثار گرانقدرش هيچ‌گاه به فراموشى سپرده نخواهد شد.