سيد مصطفى موسوى (پدر امام خمينى (قدس سره)) در سال 1320 هجرى قمرى يعنى همان سال تولد امام خمينى (قدس سره) در راه ميان اراك و خمين به دست يكى از اشرار و اوباش به شهادت رسيد.

تقدير چنين بود كه روح الله نوزاد، يتيم پرورش يابد و دست خداى مهربان را بر سر و عواطف مادر و خويشان به ويژه عمه او (بانو صاحبه) كه خود را وقف توجه و تربيت و پرورش كودك ساخته بود، همراهش باشد.

امام خمينى (قدس سره) مقدمات علوم را در شهر خمين نزد جمعى از علماى آنجا به ويژه برادر بزرگ‌تر خود، حاج آقا پسنديده فراگرفت. سپس در سال 1339 هجرى قمرى براى ادامه تحصيلات حوزوى به اراك مهاجرت كرد. در آن زمان اراك از مهم‌ترين حوزه‌هاى علميه ايران به شمار مى‌رفت و اساتيد علوم اسلامى و روحانيون برجسته بسيارى و پيشاپيش آنان آيت‌الله شيخ عبدالكريم حائرى بنيان‌گذار حوزه علميه قم، در اين شهر حضور داشتند.

هنگامى كه آيت‌الله شيخ عبدالكريم حائرى در سال 1340 هجرى قمرى تصميم به عزيمت به قم گرفتند، امام خمينى (قدس سره) از جمله همراهانى بود كه با ايشان در اين شهر مستقر گشت و از محضر آيت‌الله حائرى در دروس خارج فقه و اصول بهره گرفت و به مرحله اجتهاد نايل آمد. در هيئت و نجوم نيز مدتى از محضر شيخ على اكبر يزدى و در عرفان از محضر عارف و فيلسوف بزرگ‌