سپس به همراه او در زمان مظفرالدین شاه به اصفهان آمد. مدّتی نیز به نجف اشرف
رفت و به حضور آخوند خراسانی رسید. در اصفهان نزد مرحوم شیخ حسنعلی
نخودکی مرتاض معروف درس خواند و با دختر مرحوم تویسرکانی ازدواج نمود و
در محلّه جویباره ساکن شد. وی در اسفند ماه 1357 ربیع الاول 1398 قمری در
سنّ 92 سالگی وفات نمود و در تخت فولاد کنار پدرش مدفون شد. فرزندش
مرحوم سیّد محمّد علّامه فانی از شاگردان آیه الله حاج آقا حسین خادمی و حاج آقا
صدر کوپایی بود.