اللَّه عليهم) اهتمام خاصّ بهذا الكتاب بحيث كان في حوزة تدريسهم وكانوا يكتبون عليه حواشي وتعليقات.

اتّبع الإمام الخميني (س) في تعليقته على «مصباح الانس» نفس المنهج الذي اتّبعه في التعليقة على «شرح الفصوص» أي‌أنّه راعى الانسجام و التناسب بين أركان المباحث العرفانيّة بالإضافة إلى تحقيق المطالب و المسائل في هذا المجال. و قد قام بنقد الآراء و الأقوال حيث لم يجدها متوافقة مع البرهان أو منطبقة على الذوق العرفاني.

قام الإمام في هذه التعليقات بنقل الأقوال و الآراء الصادرة عن أكابر الفلسفة والعرفان و الفحص عنها كأمثال ابن سينا وابن عربي و القونوي و الفرغاني وعبدالرزّاق الكاشاني و الملاصدرا و الميرزا هاشم الإشكوري واستاذه المرحوم الشاه آبادي ونقد في أكثر من عشرين مورداً ما أورده الفناري صاحب «مصباح الانس» من الآراء.

ومن بين الموضوعات الواردة في هذه التعليقات التي جرى حولها الفحص والتحقيق، يمكن الإشارة إلى عناوين مثل الفيض الأقدس و الفيض المقدّس والألسنة الخمسة و الفيض المنبسط و التجلّيات وكمال الجلاء والاستجلاء والإنسان الكامل و الشهود و المكاشفة و الدعاء وغيرها.

كانت بداية التعليقة على مصباح الانس عام 1350 ق واستمرّت بعد انتقال آية اللَّه الشاه آبادي إلى طهران و هو عند التعليقة الرقم 57 و التعليقة الأخيرة (الرقم 132) ترتبط بالصفحة 132 (من الطبعة الحجرية من مصباح الانس) في 26 من جمادي الثانية عام 1355 ق في بلدة خمين.