ولمّا نشب الخلاف بين الزيدية وبين المطرفية (إحدى الفرق المنشقة عليها)، بعثه المتوكل إلى العراق لمناقشة هذا الأمر، فعاد إلى اليمن مصاحباً شيخه البيهقي ليستعين به على فضّ الخلاف، حاملاً معه كتب المعتزلة ليحتجّ بها على المطرفية، وذلك في عام (544هـ).

ثمّ رجع مع شيخه البيهقي إلى العراق لمواصلة دراسته، فأخذ عن القاضي أبي الحسن أحمد بن أبي الحسن الكني(تلميذ البيهقي).

ثمّ عاد إلى اليمن حائزاً على علوم كثيرة من الأُصول والفروع والمعقول والمسموع.[1]

وتصدّى للتدريس بقرية سناع، فتتلمذ عليه كثيرون كالحسن الرّصّاص، وأحمد بن الحسين الأكوع.

ووضع تآليف كثيرة، منها: الدامغ للباطل[2] في العقائد، خلاصة الفوائد(ط) اختصره من «الدامغ للباطل»، الفائض المحيط في الإمامة، النقض على صاحب المجموع المحيط فيما خالف فيه الزيدية في باب الإمامة، أركان القواعد في الردّ على المطرفيّة، إبانة المناهج في نصيحة الخوارج، تقويم المائل وتعليم الجاهل في الردّ على المطرفية، المسائل الإلهية، المسائل العقلية، شرح قصيدة الصاحب بن عبّاد في أُصول الدين، الرسالة الجامعة، الرسالة القاهرة، العمدة، البالغة في أُصول الفقه، ونكت العبادات وجمل الزيادات(ط) في الفقه، وغير ذلك.